研究团队首先收集了100毫升废水样本,然后进行预离心并使用浓缩移液管(Concentrating Pipette, CP)超滤法进行浓缩,显著增强了检测能力。病毒浓缩物使用Qiagen的QIAmp Viral Mini Kit提取。为了进一步了解冠状病毒的流行情况,还处理了来自蝙蝠粪便和其他动物来源的样本。
研究人员随后将新的测序方法与传统的非靶向方法进行了比较,发现浓缩移液管方法在读取获取方面提供了近三个数量级的增长。这一数据准确性的大幅提升对于识别冠状病毒的潜在中间宿主和储存库至关重要。通过其方法的优化,研究团队使用目标富集测序(Targeted Enrichment Sequencing, TES)和非靶向病毒宏基因组学(Untargeted Viral Metagenomics, UVM)分析了样本。他们的发现凸显了一体化健康方法在预测和应对病毒爆发中的重要性,增强了公共卫生领域的监测解决方案。
“获得的信息可以显著贡献于冠状病毒的早期检测、监测及控制措施,包括病毒发现和潜在的溢出事件。”该出版物指出。
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标题:目标富集元病毒组学实现对环境和动物样本中冠状病毒的全面监测,
作者:Martínez-Puchol等人,《Heliyon》期刊,2024年。
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