2023年,爱尔兰最大的湖泊之一发生了前所未有的有害藻华现象,这对公共安全构成了风险。为了了解湖水中微生物群落的转变以及致病微生物的生长速度,研究人员利用卫星成像和通过浓缩移液器™(CP Select™)浓缩的水样进行了调查。
一、样本采集与处理
1.空间变异评估采样
为了评估空间变异情况,从距离湖岸大约3 - 4公里的20个位置采集了1升表层水样。
将采集到的水样剧烈摇晃,使团块破碎并确保均匀混合,然后将每个样本分成三个50毫升的Falcon管,从而创建每个位置具有相同藻类密度的重复样本。
2.样本浓缩
使用带有0.45 µm滤头的CP Select™浓缩移液器对表层水样进行浓缩。
3.微生物DNA分析
提取微生物DNA,并使用Nanopore技术对全长16S rRNA基因进行测序。
二、结果发现
分析结果显示存在多种蓝藻,其中包括微囊藻(Microcystis aeruginosa),这是淡水中最常见的有毒蓝藻种类。这些蓝藻会产生神经毒素,能够损害或削弱人类和动物的神经系统。
三、技术优势
InnovaPrep公司的FluidPrep系列产品(如浓缩移液器)能够快速浓缩样本,提供了一种更快、更简便的方法来提高检测的灵敏度,从而能够早期检测到甚至是微量致病因子,有助于避免公共健康风险。
阅读文献:
Reid, et al. Environment International, 2024年8月. 《英国和爱尔兰最大湖泊中与胃肠道细菌、微囊藻毒素和类鞭毛藻肽有关的首例有害藻华:环境和公共健康风险》
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