《微生物组杂志》上的一篇文章介绍了NASA科学家如何对火星探测器装配设施中的生物负荷进行基因组调查。
样品取自喷气推进实验室的航天器装配地板(SAF)洁净室,并使用Concentrating Pipette(CP)快速浓缩,这是一种比传统耗时且劳动密集型富集方法更高效的替代方案。这些浓缩样品随后被分成较小的部分,并使用传统的NASA孢子检测法和先进的技术(包括PMA-qPCR、桑格测序、Illumina测序、单细胞基因组分析和培养)进行分析。通过这些分析,识别出了八种额外的可存活孢子形成菌属。
Concentrating Pipette使人们能够发现大量无法通过既定NASA标准孢子检测法(NSA)检测到的微生物。
“观察到的生物负荷丰度和多样性受到分析方法选择的严重影响……同时利用基于培养的方法和分子方法是必要的,以向科学界提供更完整的生物负荷成分图景。”
“这突显了方法论范式转变的重要性,不仅适用于航空航天行业,还适用于制药、医疗等行业,以适当监测洁净室中的生物负荷。”
Concentrating Pipette(CP)有效地从NASA洁净室中浓缩了微量微生物,结合单细胞基因组等先进技术,实现了对关键空间中微生物环境的精确监测和深入理解。
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《洁净室微生物组复杂性影响行星保护生物负荷》
作者:Hendrickson 等
《微生物组杂志》2021年
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